Profinity eXact亲和树脂可以装在Bio-Rad Econo-Pac层析柱中。一般每个柱子可装1-4ml的树脂。一倍柱体积（CV）相当于一体积树脂（1CV=1ml，对于装有1ml树脂的柱子来说）。
在样品上柱前留出少量的裂解液。在后面的分析中（如：SDS-PAGE），这部分样品将作为对照泳道上样。

缓冲液和层析柱准备
1．冲洗缓冲液（0.1M磷酸钠，pH7.2）。
要避免缓冲液中含NaCl。配好的缓冲液放置于4℃保存。
2．洗脱缓冲液（0.1M磷酸钠，0.1M氟化钠，pH7.2）。
3．清洗缓冲液（0.1M磷酸）。
4．保存缓冲液（0.02%叠氮化钠，0.1M磷酸钠，pH7.2）。

层析柱准备
5．轻柔的混合树脂，使其重悬为50%（V/V）树脂浆。
6．把2-8ml 50%树脂浆转移到Econo-pac柱子中，并排掉保存缓冲液。

上样和冲洗
7．用10倍柱体积冲洗缓冲液平衡柱子。
    因为保存缓冲液中含有0.02%的叠氮化钠用来抑菌，为了去除叠氮化物对离子的激发作
用，这步预平衡是必须的。用冲洗缓冲液上柱并靠重力使其流出。
8．预冷（4℃）的细胞裂解液上柱。
裂解液上柱并靠重力流出。
9．用至少15倍柱体积冷的冲洗缓冲液冲洗柱子。
这步可以根据纯化蛋白的需要增加额外的冲洗步骤。冲洗后用塞子把柱子塞好。

洗脱
10．5倍柱体积洗脱缓冲液上柱。
用吸管混合树脂和洗脱缓冲液。
11. 在室温下，使树脂在洗脱缓冲液下孵育至少30分钟。
如果在4℃下孵育，则至少孵育12小时。
12．收集纯化蛋白。
拿掉塞柱子的塞子，让含有纯化蛋白的洗脱液流出并对其进行收集。

清洗
13．用至少5倍柱体积冲洗缓冲液冲洗柱子。
14．用3倍柱体积清洗缓冲液清洗柱子。
15．用5倍柱体积冲洗缓冲液平衡柱子。
16．用2倍柱体积保存缓冲液平衡柱子，盖好柱子，并于4℃保存。