一．打开DNA Engine Tetrad 2 PCR仪电源
打开电源后，仪器开始启动，此过程约持续一分半钟，在此过程中，仪器LCD界面将显示如下几个选项：
Selftest：选择数字1可使仪器执行自检和报错。
Send Files：选择数字2可执行程序文件的传送。
Rreceive Files：选择数字3可执行程序文件的接受。
如果不进行选择仪器将在约6秒钟之后自动跳出启动状态。
启动过程完成后，仪器的状态界面显示，仪器已可以开始接受，编辑及执行程序。
二．控制面板
控制面板包括显示屏，光标键及数字输入键：
显示屏：1/4大小VGA屏幕可显示仪器的加热条件及程序运行状态。
方向键（左键，右键，下一步键，向后键）：用来在显示屏中移动光标
数字键：输入数值
Enter键（位于方向键下方）：用来接受设定的程序条件和修改
注意：额外的鼠标可以用来执行选择命令，访问菜单，在列表中进行选项切换。
三．程序相关设定
1．基本设置
温度控制模式：有两种控制模式，Calculated和Block。仪器默认为Calculated模式，此模式可进行温度补偿。
热盖控制模式：三种热盖模式，Off，Tracking，Constant。仪器默认为Constant。
温度步骤：为孵育温度和维持时间设定。仪器的默认设定升温速度为最大升温速度，3度/秒，降温速度为2度/秒。
梯度步骤：96孔板上可执行温度梯度。从左到右温度梯度最大跨度为24度，最小为1度。最大的设定温度为105度。最小的设定温度为30度。
Goto步骤：循环的步骤及循环数设置。
End步骤：自动产生，为程序结束步骤。
2．高级设置
温度增减：可设置每个循环步骤中温度增加或降低（0.1度到10.0度每个循环）。
时间增减：可设置每个温度步骤中每个循环的时间延长和缩短。
升温速度降低：可设置仪器的升温速度低于最大升温速度。仪器的的最小速率为0.1度/秒。
警报：在温度步骤或升温步骤中当设定温度达到后进行警报。
四．程序的类型
有两种类型的程序，Basic和Advanced。Basic程序以图形界面显示程序各步骤。Advanced程序以文本界面显示。

输入程序
一旦仪器完成启动程序，
状态窗口将显示。

 

 

 

1．在图形模式下输入程序
A．选择Programs：
用指尖在触摸屏上点击Programs，子菜单中显示Open，New，Folder，Copy，Move和Delete，选择New，再选择Basic Mode。图形程序窗口显示，此窗口无程序步骤或有最后保存的程序。新程序的默认名称为TEMPLATE。新的图像程序必须进行保存后才能运行。选择Save As，文件保存窗口出现，程序将被加入Folder中。选择New Folder创建新文件夹，在Edit KeyPad窗口中选择字母输入文件夹的名字，该名字不超过八个字符。输好后选择OK，返回File Save As窗口。把光标放在新建的文件夹上进行选择，然后选择Edit Name。用Edit KeyPad窗口输入程序的名字。选择OK。返回File Save As窗口。此时选OK，程序将存入硬盘。
B．文件夹密码
在为新文件夹命名后，New Folder窗口将显示Edit Password按键。选择New窗口旁边的Edit按钮。输入密码，选择OK确认。
C．图形编辑窗口
步骤的选择及步骤参数的修改
当某一步被选中时，该步骤线或箭头将变为红色。把光标放至于步骤栏点击一次可选中此步骤。光标置于该步骤的温度或时间区后，点击一次，可进行修改。使用backspace删除当前数值，用数字键输入需要的温度，时间或循环数。点击鼠标一次接受变更。
步骤删除
首先选中要删除的步骤，选择Delete Step按钮，选中步骤将被删除，下一步将自动提前。
步骤增加
在图形模式中，可以在当前选中的步骤后直接增加一步。图形模式可包含六个温度和梯度范围及一个goto步骤。选择增加一步，然后选择Temp，Grad或Goto按键增加温度，梯度或Goto步骤。
输入Goto步骤
选择Goto步骤，然后选择Delete步骤，选择步骤数（在Goto循环中的终止的步骤数），选择Goto，此时一个小的红色箭头将出现在所选步骤下面。选择步骤（在Goto循环中的开始的步骤数）。此时箭头将延伸至此开始步骤，默认循环数为25。选择循环数并删除默认值，输入需要的数值，点击一次接受更改。
永久（Forever Incubation）孵育的设置
选择Forever窗口可进行Forever Incubation的设置，仪器可以维持在4度，但不建议长期在此温度下保存样品。
2．在高级模式下进行程序编辑
选择Programs
下拉的子菜单会包括Open，New，Copy，Move，Delete，Delete Folder和New Folder。选择New，然后选择Advanced Mode。Mode Selection窗口出现，在此窗口中可以选择Temperature Control Mode或Lid Control Mode。选择OK接受更改并退出模式选择窗口，返回高级程序窗口。
输入温度步骤
把光标移到Lid Control Mode步骤上并鼠标左键。选择Temp，温度步骤窗口包含温度调节选项。把光标移到Temperature区并选择，用数字键输入所需温度。在维持时间区域输入维持时间。
选择警报，选择OK。
把光标移到正确的插入点，第一步将高亮显示，插入步骤位于此步之后。
选择Temp，把光标移到Temperature并选择，输入所需温度，输入维持时间，设置警报，选择OK。
在程序列表中高亮显示此步，选择Gradient。
选择最低温度，输入所需数值，选择最高温度，输入数值，选择时间并输入数值。
新创建的梯度可以通过图形浏览。选择Preview。

浏览后选择Close，选择OK。     

                                     

                                                                                        
时间增加选项
在温度区输入数值，在时间区输入数值后，选择Extend Time，选择Set Parameters，在Extend Time窗口中选择Incerase，在by_seconds per cycle区输入每个循环增加的时间数值。选择OK。

Goto步骤设置
选择Goto，显示Goto步骤窗口。输入循环中开始步骤，并输入额外的循环数目。选择OK。
温度速率设置
在Temperature Step窗口，点击Temp按钮，输入温度和时间，选择Slow Ramp，选择Set Parameters。在Slow Ramp窗口中输入数值，选择OK。
温度增加设置
在温度步骤窗口点击Temp，输入温度和时间后，选择Increment Temp，选择Set Parameters。选择Increase或Decrease，输入每个循环增加或降低的温度数值，选择Ok。
程序编辑完毕后，选择Save进行保存。
五．程序的管理与修改
1．程序的打开
保存在PCR仪中的程序都可以打开，编辑和运行。选择Programs，点击Open。选择Advanced Mode或Basic Mode打开程序。
A．在高级模式下打开程序
选择Advanced Mode，在子菜单中选择程序保存的文件夹，选择程序后，点击OK。如果程序中含有高级的设置选项，警报等，该程序不能在Basic模式下打开，只能在高级模式下打开。确认窗口跳出后，点击Yes打开文件。
B．在Basic模式下打开文件
图形文件即可以在图形程序窗口或高级程序窗口中打开和编辑。
选择Peograms，点击Open ，选择Basic Mode。选择文件夹和程序，点击OK。
2．编辑图形程序
在图形程序界面下，移动光标到需要编辑的步骤上，在温度或/和时间等区域输入新的数值，点击一次接受更改。
编辑高级程序
高亮显示并选择程序步骤，可进行步骤的删除，插入和编辑。
3．文件夹的设置
对文件夹可以进行保存，复制，删除和移动。除保存选项外，其它的选项可在菜单栏的状态窗口中Programs下拉菜单中进行选择。
程序保存：保存选择Save或Save As可进行程序的保存
程序复制：选择Copy，选择From Folder和准备复制到的文件夹To Folder，选择Copy Program列表中的程序，点击Copy。选择Exit返回状态窗口。
删除程序
在状态窗口选择Programs，从下拉菜单中选择Delete。选择包含要删除的程序的文件夹，选择程序，点击delete。在删除确认窗口中点击Yes。
移动程序
在状态窗口选择Programs，从下拉菜单中选择Move即可。
删除文件夹
在删除文件夹之前，最好清空文件夹中的程序。在状态窗口选择Programs，在下拉菜单中选择Folder，点击Delete Folder。选择要删除的文件夹，选择Delete，在确认窗口选择Yes。
六．程序运行
在状态窗口中选择Run或从Command菜单中选择Run。在打开的程序窗口中选择要运行的文件夹及程序。点击OK。运行窗口出现。
在此窗口中可选择要运行的Block。如果温度模式为Calculated温度模式，在点击OK后，还要输入样品体积和样品管类型。点击OK开始运行。
1．运行过程中的操作
A．运行状态
在运行开始后，在状态窗口中将会显示温度，时间和循环情况。在图形界面下可显示运行条件。
选择Graphs或从View菜单中选择Graphs。
点击Status按钮可返回状态窗口。
B．终止运行
在运行结束前终止运行，从状态窗的Block选择菜单中选择正确的Block，点击Stop。还可以通过在状态窗中选择Command，点击Stop，然后点击All或在下列菜单中选择需要终止的Block。
C．暂停/重新开始运行
在状态窗口中选择正确的Block，点击Pause可暂停运行。选择Resume可重新开始运行。

D．跳到下一步
选择Skip，确认窗口出现，选择Yes，可使运行进入到下一步。
2．运行多个程序
DNA Engine Dyad PCR仪可以同时在不同的Block上运行几个程序。运行多个程序之前，首先在状态窗口中的Block选择菜单中选择可使用的Block。可使用的Block将显示Block is Inactive的信息。如果没有Block可以使用，No Blocks available的信息将出现。选择Run，按着运行程序的流程启动运行。