一．运行程序
1．接通仪器电源，打开仪器开关，仪器自检后，显示主菜单。


2．在PCR管中加入样品，把管子放入仪器中，关上盖子，准备开始实验。
3．可以用以下几种方式开始进行运行。
A．点击RUN键：点击RUN，在文件库中选择程序。再次点击RUN或ENTER开始运行。
当超过一个Block连接在仪器上时，要选择某个或多个BLOCK进行运行。首先通过点击箭头键选择一个Block并点击Select Block。然后同点击箭头键选择下一个Block并再次点击Select Block。
在不止一个Block上运行一个程序时，首先选择方法，然后点击OK开始运行。选择Start all blocks running at once或Confirm each run one at a time使仪器在同一时间运行所有Block或在某时刻运行某一个Block。
在开始运行前，确定或改变运行参数。在此输入样品体积和热盖温度等信息。
在Emulation Mode下运行（可选）：点击Options按钮，然后选择Enable Emulation Mode并制定升降温速度。
开始运行：点击OK键开始运行。
运行状态的监测：一旦开始运行后，Status屏幕将出现流程运行过程的信息以此监测运行状态。
B．在PREVIOUS RUN文件夹中选择程序并点击RUN：选择Previous Run文件夹选择需要运行的程序。然后点击RUN或ENTER键返回所选的程序。
C．打开文件库选择程序：点击主菜单中的Files打开文件库并选择一个流程。点击RUN或ENTER键运行所选择的流程。
D．运行一个编辑过的流程：在编辑一个流程后，点击Run键开始运行此程序。
E．运行一个新流程：在创建一个新流程后，点击RUN键开始运行此程序。
4．使用STATUS和VIEW键监测运行
A．用VIEW键监测运行
点击VIEW，从运行窗口切换成时间窗口。再次点击VIEW键可返回运行窗口。
B．用STATUS键监测多个Block运行状态
在运行窗口下点击Main Menu键可监测所有的Block。在主菜单状态下，所有的Block都将列出，点击STATUS键可进入所选Block的流程状态屏。
5．在运行中可点击Pause进行程序的暂停，点击Resume可继续开始运行程序。
6．点击Skip Step按钮可以跳过当前步骤进入下一步，多次点击Skip Step键可跳过相应点击次数的步骤，即如后面的步骤。
7．点击Cancel Run键可终止运行。
点击Cancel Run或Cancel All键可终止所选Block的运行或终止所有Block的运行。
8．点击INCUBATE键进行样品孵育。
点击INCUBATE键可在任何时间内的特定温度下保存样品。可点击Cancel键终止保存。（不建议在4-10度下保存样品）

二．创建和编辑新程序
1．打开一个新程序或一个已存在的程序
   A．在主菜单中选择New Protocol打开一个新的流程模版。点击EDIT键可打开文件库并选择某个流程进行编辑。
   B．某个流程以图形方式显示，点击VIEW键可在图形和文本形式之间切换。
2．改变温度设置参数。
   A．改变目标温度和维持时间：选择某一流程步骤；点击方向键选择参数；点击阿拉伯数字键输入新的参数。
   B．增加和删除温度梯度：选择某一个流程步骤，选择Options，或点击Insert及Gradient，选择温度步骤，点击Options打开Options窗口。点击阿拉伯数字键输入梯度范围。点击Done继续。在温度梯度显示框中可以预览温度梯度。
      选择梯度步骤，打开Options窗口，然后选择Gradient Range并通过点击BACK键删除范围，然后点击OK。 
   C．增加或删除温度递增功能：选择某一温度步骤，点击Options打开Options窗口，点击箭头键选择Increment窗，输入递增的温度值，点击OK完成。
      在TEXT格式下可预览温度递增流程。在Options窗口中点击BACK键可删除Increment，然后点击OK键确定。
   D．增加或删除Ramp速度：选择某一流程步骤选择Options；点击箭头键在Ramp Rate框中输入Ramp数值，点击OK键确定。可在Text形式下进行预览。在Options窗口下 点击BACK键可删除Ramp速度。
   E．增加或删除Extend时间：选择某一流程步骤选择Options，在Extent框中输入数值，点击OK键确定。可在Text形式下预览Extend时间。通过BACK键并点击OK可删除此设置。
   F．增加或删除警报：在Options窗口中还可以在所选步骤中增加Beep，点击Enter并点击Ok键确定。可在TEXT形式下预览设置，在Options窗口中再次点击Enter删除Beep，点击Ok确定设置。
3．改变GOTO步骤的参数
A．在图形或TEXT形式下选择GOTO步骤；
B．点击箭头键选择GOTO步骤中的步骤数；
C．更改GOTO循环数；
D．在TAXT形式下预览GOTO参数
4．插入和删除某一步骤
   A．选择想要插入步骤的左边步骤，点击Insert开始插入一个步骤，所插入的步骤将出现在所选步骤的后面。
   B．选择Temp插入温度步骤，选择GOTO可插入GOTO步骤，选择Gradient插入梯度步骤。
   C．新插入的步骤默认的温度为50度，默认的时间为30秒。在新的步骤中选择和编辑参数。
   D．需要删除某一步：先则某步骤，点击Delete。
5．给程序命名
 A．给新程序命名：点击箭头键至Name框，点击阿拉伯数字键输入字母或数字；点击Done确定后继续到文件库。
   B．重命名已存在的程序：在Name框中选择程序名称，点击BACK键删除原名称，输入新名称，点击ENTER确定。
6．改变样品体积和热盖温度
   A．改变样品体积：选择样品体积框Vol，输入体积数（1-50微升为Calculated温度模式，0微升为Block模式）；
   B．选择热盖温度Lid，输入热盖温度。
   C．保存程序：程序编辑完毕后，点击Done；用箭头键选择某一个文件夹或点击Edit Filename编辑文件名称或点击Create Folder创建新文件夹；当程序保存在文件夹后，可进行三种操作：点击Continue Editing继续编辑；点击Run运行程序；点击Main Menu返回主菜单。
   D．保存编辑后的程序：可进行两种方式的保存
a．替代原程序：点击Save直接进行保存。
b．选择Edit Filename输入新文件名进行保存。
三．管理程序文件和文件夹
在Main Menu中点击FILES按钮可打开文件库进行文件及文件夹的管理。在文件及文件夹选项中会出现以下相应的选项：
PROTOCOLS：
Copy/Move Protocol：拷贝或转移某个已经存在的程序至另一个文件夹处。
Delete Protocol：删除程序
Rename Protocol：重命名程序
FOLDERS：
Create Folder：创建一个新文件夹
Copy All：从某个指定处拷贝所有的文加夹至另一个已经存在的文件夹
Copy/Move Folder：拷贝或移动一个已经存在的文件夹至另一个PCR仪或U盘
Delete Folder：删除文加夹及其中的所有内容
Rename Folder：重命名文件夹
Rename Cycler：重命名PCR仪
Main Menu：返回主菜单