SNP Manager是一个功能强大的Excel文件格式，此文件由多个功能特殊工作表组成，这些工作表包含：
Assay Config：可设置位点/同源基因关联及设置基本的检测分析选项
aMFI：显示调解后（背景扣除）的平均荧光强度和平均背景值，并高亮显示SNP/同源基因
AR：计算每个同源基因的同源率并高亮显示缺失或纯合同源基因
Genotype：显示每一位点的基因型，这些基因型的判定是基于AR工作表中的同源率得来
Plate Setup：可更改样品的设置及阳性及阴性对照的设置
Options：可在此表中改变显示和分析选项
workflow：SNP Manager软件的使用介绍
Raw Data：包含有输入的原始数据

Copied Data：显示在数据工作表中（aMFI，AR

及Genotype）已经拷贝过的表格，这些数据可以从此工作表中被拷贝至其它位点。

1．打开SNPmanager2.xlt文件，保存此文件为snpmanagerxxx.xls，其中xxx是自己选择的名字。
2．把Bio-Plex数据导入到Excel中：
A．打开Bio-Plex Manager数据文件
B．浏览原始数据                               
C．把数据导入Excel
D．浏览新的Excel工作表
3．在新的工作表中，通过SNP Manager菜单选择Import New Assay。
4．改变检测设置为Present/Absent。



5．浏览或对病原体名称及检测参数进行设置：
A．在Bio-Plex Manager软件中命名病原体。
B．改变当前阀值。

6．从菜单中选择Analyze Data进行数据分析。